Hậu môn (tiếng Latinh, 'vòng' hoặc 'vòng tròn') là một lỗ ở đầu đối diện của đường tiêu hóa của động vật với miệng. Chức năng của nó là kiểm soát việc tống xuất phân, chất thải bán rắn còn sót lại sau quá trình tiêu hóa thức ăn, tùy thuộc vào loại động vật, bao gồm: chất mà động vật không thể tiêu hóa, chẳng hạn như xương; nguyên liệu thực phẩm sau khi các chất dinh dưỡng đã được chiết xuất, ví dụ như cellulose hoặc lignin; ăn phải vật chất sẽ độc hại nếu nó vẫn còn trong đường tiêu hóa; và vi khuẩn đường ruột chết hoặc dư thừa và các vi khuẩn nội cộng sinh khác.

Động vật lưỡng cư, bò sát và chim sử dụng cùng một lỗ (được gọi là cloaca) để bài tiết chất thải lỏng và rắn, để giao hợp và đẻ trứng. Các động vật có vú đơn huyệt cũng có một lỗ huyệt, được cho là một đặc điểm được thừa hưởng từ các động vật có ối sớm nhất thông qua các therapsids. Thú có túi có một lỗ duy nhất để bài tiết cả chất rắn và chất lỏng, và ở con cái, một âm đạo riêng biệt để sinh sản. Động vật có vú cái có nhau thai có các lỗ đại tiện, tiểu tiện và sinh sản hoàn toàn riêng biệt; con đực có một lỗ để đi vệ sinh và một lỗ khác để đi tiểu và sinh sản, mặc dù các kênh dẫn đến lỗ đó gần như hoàn toàn tách biệt.

Sự phát triển của hậu môn là một giai đoạn quan trọng trong quá trình tiến hóa của động vật đa bào. Nó dường như đã xảy ra ít nhất hai lần, theo những con đường khác nhau trong động vật nguyên sinh và động vật có xương sống. Điều này đi kèm hoặc tạo điều kiện thuận lợi cho những phát triển tiến hóa quan trọng khác: kế hoạch cơ thể song phương, coelom và metamerism, trong đó cơ thể được xây dựng từ các "mô-đun" lặp đi lặp lại mà sau này có thể chuyên biệt hóa, chẳng hạn như đầu của hầu hết các loài động vật chân đốt, bao gồm hợp nhất, phân khúc chuyên biệt.

Ở sứa lược có những loài có một và đôi khi có hai hậu môn vĩnh viễn, những loài như sứa lược mọc ra một hậu môn, sau đó sẽ biến mất khi không cần thiết nữa.